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Basic Information

The table below details the source and basic information of this item.

Title Content
iBAD ID iBAD_0000294
Karyotype Trisomy 21
Type Methylation profiling by genome tiling array
Diseases Down syndrome
Organism Homo sapiens
Tissue Maternal uterine
Cell Line Prenatal chorion villus cells
Platform GPL13534
Accession GSE66210
GEO Title EpigeNme analysis of first trimester CVS samples from Nrmal and Trisomy 13,18,21 pregnancies, and maternal whole blood samples.
PMID -
Article Title -
Author -
GEO Link https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE66210
Pub Link -
FTP Download ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/GSE66nnn/GSE66210/
SRA Run Selector -
SRP -

Differentially Expressed Genes

The gene expression matrix, up- and down-regulated gene list are provided. Click the three following options to download the corresponding list.

Gene ID Gene Name logFC P-value P-adj
HCN2 2.91e-01 5.51e-09 0.00155
MYO15A 9.39e-02 6.39e-09 0.00155
STK19 1.96e-01 2.57e-08 0.00331
HCN2 1.43e-01 3.22e-08 0.00331
SHROOM1 1.54e-01 4.21e-08 0.00331
STK19 1.22e-01 5.40e-08 0.00331
DKFZP434H168 2.83e-01 5.46e-08 0.00331
TNFRSF25 1.82e-01 9.18e-08 0.00474
REC8 1.06e-01 1.03e-07 0.00474
ADARB2 2.02e-01 1.07e-07 0.00474
SHROOM1 2.78e-01 1.21e-07 0.0049
C19orf20 1.91e-01 1.34e-07 0.00496
WDR24 1.14e-01 1.44e-07 0.00496
CNTFR 1.38e-01 1.64e-07 0.00496
WRB 7.12e-02 2.30e-07 0.0062
SERPINA1 1.62e-01 2.88e-07 0.00737
VWA1 1.37e-01 3.23e-07 0.00785
SYTL1 -1.12e-01 3.80e-07 0.00821
HLA-H 2.09e-01 3.99e-07 0.00821
STK19 1.98e-01 4.00e-07 0.00821
HK3 1.26e-01 4.20e-07 0.00821
STK19 1.32e-01 4.23e-07 0.00821
ZBTB47 1.30e-01 5.23e-07 0.00969
HMGN2 8.82e-02 5.39e-07 0.00969
LOC284798 2.45e-01 5.73e-07 0.00993
CASZ1 9.72e-02 8.53e-07 0.01428
TNFRSF25 2.19e-01 8.95e-07 0.01433
CPT1B 1.75e-01 9.84e-07 0.01433
HCN2 1.75e-01 1.01e-06 0.01433
SIAH3 2.24e-01 1.08e-06 0.01458
DYSF 1.03e-01 1.23e-06 0.01478
FIGN 2.18e-01 1.24e-06 0.01478
ZNF785 1.42e-01 1.26e-06 0.01478
VWA1 1.90e-01 1.30e-06 0.01478
TNFRSF25 1.81e-01 1.34e-06 0.01478
REC8 8.20e-02 1.41e-06 0.01492
STK19 1.17e-01 1.41e-06 0.01492
HLA-F 1.28e-01 1.56e-06 0.01599
SOX9 1.76e-01 1.58e-06 0.01599
PRIC285 2.27e-01 1.64e-06 0.01621
MYO1F 1.14e-01 1.69e-06 0.01645
LRRC8E 1.43e-01 1.80e-06 0.0168
WNT6 1.67e-01 2.06e-06 0.01891
C21orf33 1.44e-01 2.17e-06 0.0192
TGFBI 3.07e-01 2.21e-06 0.0192
ZNF837 1.68e-01 2.42e-06 0.02065
BAGE5 8.18e-02 2.58e-06 0.02125
ZBTB47 1.36e-01 2.72e-06 0.02125
ZNF514 1.71e-01 2.86e-06 0.02125
CASZ1 1.10e-01 2.87e-06 0.02125
WRB 8.98e-02 2.92e-06 0.02125
CPT1B 1.50e-01 2.99e-06 0.02125
CPT1B 1.47e-01 3.00e-06 0.02125
C1QL4 1.80e-01 3.01e-06 0.02125
MZF1 1.49e-01 3.02e-06 0.02125
MAN2A2 8.28e-02 3.09e-06 0.02141
PLXNB2 1.79e-01 3.13e-06 0.02141
VWA1 7.68e-02 3.21e-06 0.02157
ZNF837 2.29e-01 3.24e-06 0.02157
STK19 1.32e-01 3.42e-06 0.02215
SUMO3 1.56e-01 3.56e-06 0.0223
CUGBP2 1.56e-01 3.58e-06 0.0223
DRD5 1.08e-01 3.58e-06 0.0223
ZADH2 2.35e-01 3.77e-06 0.02284
CTBP1 7.39e-02 3.81e-06 0.02284
NME3 1.00e-01 3.96e-06 0.02344
CASZ1 1.52e-01 4.37e-06 0.02506
NCRNA00181 1.81e-01 4.41e-06 0.02506
REEP6 1.17e-01 4.44e-06 0.02506
STK19 1.15e-01 4.61e-06 0.02543
CASZ1 1.58e-01 4.70e-06 0.02543
CPT1B 1.77e-01 4.73e-06 0.02543
KIF26B 1.62e-01 4.88e-06 0.02574
ESPN 1.81e-01 5.04e-06 0.02601
PCDH24 6.24e-02 5.06e-06 0.02601
NT5C 1.19e-01 5.09e-06 0.02601
DSCAM 7.72e-02 5.28e-06 0.02637
CRHR1 8.60e-02 5.34e-06 0.02637
SLC34A1 1.05e-01 5.35e-06 0.02637
LOC284798 3.04e-01 5.38e-06 0.02637
KIF26A 1.61e-01 5.49e-06 0.02657
NAT14 1.26e-01 5.53e-06 0.02657
BEST1 8.43e-02 5.61e-06 0.02669
DYNLRB1 -1.17e-01 5.80e-06 0.02734
GPT 8.24e-02 5.86e-06 0.02735
HCN2 1.39e-01 6.34e-06 0.0293
TECTA 3.08e-01 6.76e-06 0.03038
C2orf24 7.28e-02 6.86e-06 0.03056
CPT1B 1.12e-01 7.05e-06 0.03094
SHROOM1 1.97e-01 7.07e-06 0.03094
STK19 1.31e-01 7.37e-06 0.03121
RARA 7.68e-02 7.33e-06 0.03121
ZNF282 1.20e-01 7.39e-06 0.03121
FAM83H 1.75e-01 7.39e-06 0.03121
ZNF837 1.22e-01 7.56e-06 0.03151
FAM195B -9.31e-02 7.59e-06 0.03151
CHRM4 2.23e-01 7.74e-06 0.03187
KRAS 1.00e-01 7.96e-06 0.03239
SORCS2 9.00e-02 8.00e-06 0.03239
SRRM1 1.09e-01 8.37e-06 0.03282
KIAA1875 2.27e-01 8.52e-06 0.03282
CPT1B 1.67e-01 8.68e-06 0.03282
STK19 1.44e-01 8.69e-06 0.03282
SLC24A4 8.52e-02 8.69e-06 0.03282
WFDC5 1.05e-01 8.75e-06 0.03282
FGF11 1.85e-01 8.77e-06 0.03282
OTOP1 1.20e-01 8.82e-06 0.03282
KIAA1875 1.36e-01 8.85e-06 0.03282
CHRND 1.10e-01 9.07e-06 0.03337
PLXNB2 1.26e-01 9.24e-06 0.03374
SLCO5A1 1.70e-01 9.65e-06 0.03494
FGF11 2.05e-01 9.71e-06 0.03494
MGC13005 7.20e-02 9.84e-06 0.035
HLA-B 1.32e-01 9.92e-06 0.035
MSH5 1.01e-01 9.95e-06 0.035
GJC2 2.94e-01 1.03e-05 0.03548
ProSAPiP1 1.33e-01 1.03e-05 0.03548
CPT1B 2.79e-01 1.04e-05 0.03548
CHRND 1.38e-01 1.04e-05 0.03548
ENTPD2 9.58e-02 1.07e-05 0.03593
GRAMD1B 9.98e-02 1.08e-05 0.03594
WNT9B 1.71e-01 1.09e-05 0.03594
CACNA1A 1.47e-01 1.11e-05 0.03612
GPT 2.22e-01 1.15e-05 0.03649
TNR 5.85e-02 1.16e-05 0.03649
LOC286135 1.14e-01 1.17e-05 0.03649
HSF4 1.69e-01 1.18e-05 0.03656
CXCR2 1.41e-01 1.21e-05 0.03693
CDH23 7.84e-02 1.23e-05 0.03729
HGD 1.78e-01 1.29e-05 0.03841
DHH 7.93e-02 1.30e-05 0.03852
LTB4R 1.24e-01 1.35e-05 0.03936
BNIP3 1.55e-01 1.33e-05 0.03885
C11orf95 1.53e-01 1.37e-05 0.03951
TRIM65 1.51e-01 1.38e-05 0.03958
GPT 1.47e-01 1.44e-05 0.041
NKX6-2 2.50e-01 1.45e-05 0.041
KIAA1026 1.80e-01 1.56e-05 0.0432
KCNS1 8.58e-02 1.57e-05 0.0432
GHRLOS -9.21e-02 1.58e-05 0.04322
CTBP1 1.10e-01 1.58e-05 0.04322
RHBDL1 1.35e-01 1.61e-05 0.04341
DBP 1.15e-01 1.61e-05 0.04341
COASY 9.77e-02 1.67e-05 0.04354
CDH4 1.32e-01 1.69e-05 0.04354
JSRP1 1.34e-01 1.69e-05 0.04354
KLK4 2.16e-01 1.69e-05 0.04354
DNHD1 7.85e-02 1.70e-05 0.04354
DTX1 1.33e-01 1.74e-05 0.04354
SPRR2C 8.92e-02 1.75e-05 0.04354
LOC151534 1.92e-01 1.75e-05 0.04354
SPRR1A 1.55e-01 1.76e-05 0.04354
PGLYRP2 5.92e-02 1.81e-05 0.04432
MTL5 1.14e-01 1.82e-05 0.04432
HCN2 1.62e-01 1.83e-05 0.04432
AMH 8.90e-02 1.85e-05 0.04438
CPLX1 1.02e-01 1.89e-05 0.04463
ZNF837 1.26e-01 1.89e-05 0.04463
SHROOM1 1.92e-01 1.90e-05 0.04463
FOLR3 1.03e-01 1.92e-05 0.04463
COL11A2 1.14e-01 1.93e-05 0.04463
RSPH10B 8.72e-02 1.94e-05 0.04463
HLA-C 1.28e-01 1.94e-05 0.04463
LGALS12 8.79e-02 1.95e-05 0.0447
GDF10 2.05e-01 1.97e-05 0.04477
RSPH10B 1.10e-01 1.97e-05 0.04477
WNT6 1.60e-01 2.01e-05 0.04485
ESPN 7.57e-02 2.01e-05 0.04485
HLA-H 1.71e-01 2.02e-05 0.04485
TNXB 7.15e-02 2.05e-05 0.04485
FAM159A 1.25e-01 2.05e-05 0.04485
NME2 1.00e-01 2.06e-05 0.04485
SHROOM1 1.48e-01 2.07e-05 0.04485
PAIP1 8.04e-02 2.09e-05 0.04485
LOC284798 2.00e-01 2.09e-05 0.04485
MAP7D2 2.28e-01 2.10e-05 0.04485
ADARB2 2.31e-01 2.12e-05 0.04508
ZNF785 1.89e-01 2.15e-05 0.04559
MMP25 1.41e-01 2.16e-05 0.04566
CPLX2 1.27e-01 2.19e-05 0.04606
C6orf136 8.99e-02 2.23e-05 0.04647
FOXH1 1.92e-01 2.25e-05 0.04647
VWA1 1.09e-01 2.26e-05 0.04647
WDR86 2.07e-01 2.28e-05 0.04647
MZF1 2.52e-01 2.29e-05 0.04647
PLXNB2 1.32e-01 2.31e-05 0.04647
CASZ1 9.46e-02 2.32e-05 0.04647
PACSIN1 1.71e-01 2.32e-05 0.04647
ZNF662 1.14e-01 2.33e-05 0.04647
WDR86 1.18e-01 2.33e-05 0.04647
COL13A1 1.64e-01 2.33e-05 0.04647
CPT1B 1.15e-01 2.34e-05 0.04647
CASZ1 3.01e-01 2.34e-05 0.04647
ABCA7 1.98e-01 2.36e-05 0.0466
MEPCE 1.41e-01 2.41e-05 0.04691
ZNF34 8.62e-02 2.46e-05 0.04746
ACAP3 1.40e-01 2.47e-05 0.04746
CASZ1 1.54e-01 2.49e-05 0.04746
NCRNA00181 1.54e-01 2.49e-05 0.04746
CCRL2 9.97e-02 2.52e-05 0.04773
INHBB 2.45e-01 2.53e-05 0.04773
MFHAS1 9.48e-02 2.54e-05 0.04773
KHDRBS1 1.33e-01 2.55e-05 0.04784
AMIGO3 1.56e-01 2.57e-05 0.04807
SFRP1 1.36e-01 2.60e-05 0.04821
SUMO3 9.17e-02 2.60e-05 0.04821
GUSBL2 1.04e-01 2.63e-05 0.04821
PAQR9 1.01e-01 2.66e-05 0.04821
MERTK 4.90e-02 2.66e-05 0.04821
NES 1.04e-01 2.66e-05 0.04821
MIR219-1 9.21e-02 2.67e-05 0.04821
GJB5 8.56e-02 2.67e-05 0.04821
ALX3 1.07e-01 2.71e-05 0.04848
TSPAN32 7.44e-02 2.72e-05 0.04848
C18orf1 1.55e-01 2.73e-05 0.04848
C11orf95 1.91e-01 2.75e-05 0.04848
PAX4 1.36e-01 2.77e-05 0.04848
FAM20C 1.18e-01 2.79e-05 0.04848
MIB2 1.68e-01 2.79e-05 0.04848
ZNF862 1.52e-01 2.81e-05 0.04848
REC8 1.23e-01 2.83e-05 0.04868
CASZ1 1.62e-01 2.84e-05 0.04868
CASZ1 1.18e-01 2.87e-05 0.04868
MIR942 -8.93e-02 2.88e-05 0.04868
CACNA1E 1.64e-01 2.89e-05 0.04868
KIAA1875 2.45e-01 2.93e-05 0.04868
ULK2 8.75e-02 2.96e-05 0.04868
DOC2A 1.08e-01 2.97e-05 0.04868
HOMER3 1.35e-01 2.98e-05 0.04868
ZFPM1 7.64e-02 3.02e-05 0.049
HLA-C 1.45e-01 3.08e-05 0.04976
HOMER3 2.06e-01 3.09e-05 0.04976
FLJ23834 7.89e-02 3.10e-05 0.04976
KIAA0562 9.72e-02 3.10e-05 0.04976
ANKRD33B 1.45e-01 3.12e-05 0.04991
MGC23270 6.59e-02 3.15e-05 0.05013
ADARB2 1.85e-01 3.18e-05 0.05027
TNXB 1.06e-01 3.19e-05 0.05027
MINA -7.42e-02 3.21e-05 0.05028
ZNF843 1.80e-01 3.25e-05 0.05043
CLSTN3 1.60e-01 3.27e-05 0.05061
TMEM64 7.61e-02 3.40e-05 0.052
LOC283761 9.11e-02 3.42e-05 0.05219
C15orf27 1.18e-01 3.45e-05 0.05219
C7orf51 -1.92e-01 3.47e-05 0.05219
TNXB 9.60e-02 3.48e-05 0.05219
ZFP36L2 8.05e-02 3.48e-05 0.05219
RPP14 1.13e-01 3.51e-05 0.05219
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MOCOS 9.14e-02 4.54e-04 0.12202
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VAV3 8.35e-02 4.65e-04 0.12291
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NACC2 6.13e-02 4.67e-04 0.12292
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TNXB 7.18e-02 9.08e-04 0.15015
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EBF2 1.43e-01 1.59e-03 0.17298
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