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Basic Information

The table below details the source and basic information of this item.

Title Content
iBAD ID iBAD_0000280
Karyotype Trisomy 21
Type Methylation profiling by array
Diseases Down syndrome
Organism Homo sapiens
Tissue Brain
Cell Line Cerebral cortex
Platform GPL13534
Accession GSE73747
GEO Title Epigenetic Dysregulation in the Developing Down Syndrome Brain
PMID 27245352
Article Title Epigenetic dysregulation in the developing Down syndrome cortex
Author El Hajj N, Dittrich M, Böck J, Kraus TF, Nanda I, Müller T, Seidmann L, Tralau T, Galetzka D, Schneider E, Haaf T
GEO Link https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE73747
Pub Link https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27245352
FTP Download ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/GSE73nnn/GSE73747/
SRA Run Selector -
SRP -

Differentially Expressed Genes

The gene expression matrix, up- and down-regulated gene list are provided. Click the three following options to download the corresponding list.

Gene ID Gene Name logFC P-value P-adj
NC_000022.10 CPT1B 3.25e-01 4.48e-20 2.09e-14
NC_000022.10 CPT1B 2.84e-01 3.26e-19 7.58e-14
NC_000022.10 CPT1B 3.18e-01 7.35e-19 1.14e-13
NC_000022.10 CPT1B 2.71e-01 1.32e-18 1.54e-13
NC_000022.10 CPT1B 2.03e-01 1.21e-17 1.13e-12
NC_000022.10 CPT1B 1.92e-01 1.60e-17 1.24e-12
NC_000022.10 CPT1B 3.02e-01 3.17e-17 2.11e-12
NC_000008.10 FAM83H 2.73e-01 4.36e-17 2.54e-12
NC_000008.10 LRRC14 1.41e-01 5.45e-17 2.82e-12
NC_000019.9 RYR1 2.58e-01 6.53e-17 3.04e-12
NC_000008.10 LRRC24 2.47e-01 2.52e-16 9.95e-12
NC_000006.11 STK19 1.72e-01 2.78e-16 9.95e-12
NC_000019.9 FKRP 2.58e-01 1.64e-15 5.44e-11
NC_000003.11 CELSR3 1.48e-01 2.19e-15 6.40e-11
NC_000022.10 CPT1B 1.97e-01 2.20e-15 6.40e-11
NC_000008.10 LRRC24 1.60e-01 3.16e-15 8.66e-11
NC_000005.9 FBXW11 -8.00e-02 3.41e-15 8.83e-11
NC_000021.8 WRB 7.97e-02 5.00e-15 1.22e-10
NC_000006.11 TAPBP 5.25e-02 5.22e-15 1.22e-10
NC_000006.11 STK19 1.65e-01 6.78e-15 1.50e-10
NC_000006.11 STK19 1.34e-01 7.41e-15 1.52e-10
NC_000006.11 STK19 1.93e-01 7.62e-15 1.52e-10
NC_000006.11 ZBTB22 1.40e-01 7.83e-15 1.52e-10
NC_000008.10 FAM83H 2.59e-01 9.51e-15 1.77e-10
NC_000017.10 SPAG5 1.50e-01 1.07e-14 1.92e-10
NC_000019.9 RYR1 1.87e-01 1.15e-14 1.98e-10
NC_000022.10 CPT1B 3.45e-01 1.29e-14 2.11e-10
NC_000006.11 ZBTB22 1.89e-01 1.64e-14 2.55e-10
NC_000019.9 PTPRS -1.90e-01 2.22e-14 3.23e-10
NC_000006.11 ZBTB22 1.37e-01 2.44e-14 3.44e-10
NC_000006.11 STK19 1.46e-01 3.04e-14 4.17e-10
NC_000006.11 STK19 1.52e-01 3.19e-14 4.25e-10
NC_000005.9 ZNF354C 1.33e-01 3.70e-14 4.70e-10
NC_000006.11 ZBTB22 1.39e-01 3.74e-14 4.70e-10
NC_000019.9 ZNF837 2.14e-01 4.42e-14 5.42e-10
NC_000019.9 SPHK2 1.55e-01 5.01e-14 5.99e-10
NC_000019.9 RYR1 2.23e-01 1.01e-13 1.17e-09
NC_000003.11 AMIGO3 2.10e-01 1.03e-13 1.17e-09
NC_000022.10 MEI1 1.46e-01 1.09e-13 1.21e-09
NC_000006.11 ZBTB22 1.17e-01 1.24e-13 1.34e-09
NC_000010.10 SORCS3 1.73e-01 1.33e-13 1.41e-09
NC_000019.9 ZNF837 2.75e-01 1.48e-13 1.50e-09
NC_000003.11 CELSR3 1.94e-01 1.48e-13 1.50e-09
NC_000007.13 CLIP2 -1.20e-01 1.79e-13 1.77e-09
NC_000006.11 ZBTB22 9.42e-02 1.86e-13 1.80e-09
NC_000001.10 ZNF670 1.47e-01 2.80e-13 2.66e-09
NC_000017.10 SPAG5 1.66e-01 3.11e-13 2.78e-09
NC_000006.11 TAPBP 9.75e-02 3.15e-13 2.78e-09
NC_000006.11 DOM3Z 5.37e-02 3.17e-13 2.78e-09
NC_000006.11 STK19 1.78e-01 3.33e-13 2.86e-09
NC_000008.10 GPT 1.52e-01 3.38e-13 2.86e-09
NC_000006.11 ZBTB22 9.64e-02 3.48e-13 2.89e-09
NC_000022.10 MEI1 1.03e-01 4.68e-13 3.76e-09
NC_000006.11 ZBTB22 1.11e-01 4.86e-13 3.77e-09
NC_000019.9 RYR1 2.18e-01 5.40e-13 4.12e-09
NC_000005.9 ZNF354C 9.44e-02 6.12e-13 4.59e-09
NC_000006.11 ZBTB22 8.96e-02 7.50e-13 5.46e-09
NC_000021.8 MIR155HG -6.25e-02 7.81e-13 5.60e-09
NC_000003.11 PRRT3 1.24e-01 8.76e-13 6.18e-09
NC_000006.11 ZBTB22 1.19e-01 1.29e-12 8.83e-09
NC_000021.8 PKNOX1 5.41e-02 1.32e-12 8.92e-09
NC_000019.9 RYR1 2.32e-01 1.48e-12 9.83e-09
NC_000019.9 MZF1 1.65e-01 1.56e-12 1.00e-08
NC_000011.9 EEF1G 1.04e-01 1.57e-12 1.00e-08
NC_000003.11 CELSR3 6.71e-02 1.57e-12 1.00e-08
NC_000006.11 ZBTB22 4.49e-02 1.75e-12 1.09e-08
NC_000006.11 ZBTB22 9.93e-02 2.54e-12 1.48e-08
NC_000009.11 C9orf66 2.01e-01 2.55e-12 1.48e-08
NC_000006.11 HFE 5.94e-02 2.58e-12 1.48e-08
NC_000006.11 DOM3Z 1.29e-01 2.59e-12 1.48e-08
NC_000022.10 CPT1B 1.12e-01 2.59e-12 1.48e-08
NC_000011.9 NPAS4 1.28e-01 2.61e-12 1.48e-08
NC_000021.8 OLIG1 -9.28e-03 2.75e-12 1.53e-08
NC_000019.9 ZNF837 2.45e-01 2.80e-12 1.53e-08
NC_000003.11 CELSR3 1.84e-01 3.06e-12 1.66e-08
NC_000011.9 NPAS4 1.21e-01 3.31e-12 1.77e-08
NC_000008.10 LOC100130274 1.19e-01 3.38e-12 1.79e-08
NC_000006.11 ZBTB22 9.56e-02 3.64e-12 1.91e-08
NC_000015.9 UNC45A 1.59e-01 3.71e-12 1.92e-08
NC_000019.9 ZNF837 1.85e-01 4.25e-12 2.15e-08
NC_000021.8 C21orf82 4.54e-02 4.43e-12 2.22e-08
NC_000006.11 C6orf154 8.53e-02 4.75e-12 2.35e-08
NC_000007.13 NOS3 -4.21e-02 4.83e-12 2.37e-08
NC_000006.11 ZBTB22 7.71e-02 4.94e-12 2.40e-08
NC_000012.11 GOLGA3 -5.48e-02 5.01e-12 2.40e-08
NC_000019.9 SIX5 5.97e-02 5.66e-12 2.66e-08
NC_000022.10 CPT1B 1.16e-01 5.74e-12 2.67e-08
NC_000008.10 LOC100130274 1.35e-01 6.07e-12 2.80e-08
NC_000003.11 TRAIP 1.07e-01 6.35e-12 2.90e-08
NC_000022.10 MEI1 9.50e-02 6.78e-12 3.07e-08
NC_000014.8 AK7 1.45e-01 7.20e-12 3.23e-08
NC_000019.9 SPRED3 1.83e-01 8.04e-12 3.55e-08
NC_000006.11 ZBTB22 8.79e-02 8.09e-12 3.55e-08
NC_000006.11 ZBTB22 7.44e-02 8.37e-12 3.64e-08
NC_000003.11 PRRT3 1.45e-01 8.68e-12 3.74e-08
NC_000008.10 GPT 7.09e-02 9.32e-12 3.98e-08
NC_000022.10 CELSR1 -5.40e-02 9.43e-12 3.99e-08
NC_000021.8 PSMG1 -1.16e-02 1.04e-11 4.32e-08
NC_000014.8 LTB4R 1.52e-01 1.00e-11 4.21e-08
NC_000021.8 PRDM15 -5.59e-02 1.05e-11 4.32e-08
NC_000021.8 DONSON 6.23e-02 1.14e-11 4.67e-08
NC_000019.9 MZF1 1.02e-01 1.16e-11 4.69e-08
NC_000006.11 ZBTB22 1.33e-01 1.39e-11 5.56e-08
NC_000015.9 RCCD1 8.15e-02 1.40e-11 5.56e-08
NC_000019.9 FKRP 1.45e-01 1.50e-11 5.85e-08
NC_000019.9 CYTH2 2.32e-01 1.68e-11 6.52e-08
NC_000019.9 HMG20B 1.51e-01 1.75e-11 6.74e-08
NC_000001.10 C1orf35 2.17e-01 1.92e-11 7.32e-08
NC_000021.8 ADAMTS1 -4.07e-02 1.99e-11 7.54e-08
NC_000016.9 ZCCHC14 -9.63e-02 2.42e-11 9.09e-08
NC_000016.9 HAGHL 1.18e-01 2.70e-11 9.99e-08
NC_000016.9 SPIRE2 7.65e-02 3.22e-11 1.18e-07
NC_000006.11 ZBTB22 1.34e-01 3.38e-11 1.23e-07
NC_000021.8 ADAMTS1 -9.05e-03 3.42e-11 1.24e-07
NC_000017.10 NARF 1.58e-01 3.65e-11 1.31e-07
NC_000008.10 LRRC24 8.50e-02 3.82e-11 1.35e-07
NC_000022.10 SMC1B 1.11e-01 3.96e-11 1.39e-07
NC_000003.11 CELSR3 1.12e-01 4.89e-11 1.67e-07
NC_000014.8 AK7 1.60e-01 5.12e-11 1.73e-07
NC_000019.9 HMG20B 1.27e-01 5.49e-11 1.83e-07
NC_000008.10 DERL1 9.36e-02 5.50e-11 1.83e-07
NC_000015.9 UNC45A 1.36e-01 5.61e-11 1.85e-07
NC_000015.9 UNC45A 1.65e-01 6.20e-11 2.03e-07
NC_000014.8 LTB4R 1.10e-01 6.50e-11 2.10e-07
NC_000008.10 GPT 1.64e-01 6.69e-11 2.15e-07
NC_000007.13 PRKAR1B -7.59e-02 8.06e-11 2.55e-07
NC_000017.10 SPAG5 1.25e-01 8.63e-11 2.68e-07
NC_000011.9 USP35 1.25e-01 8.65e-11 2.68e-07
NC_000014.8 TMEM121 9.87e-02 8.99e-11 2.77e-07
NC_000011.9 C11orf61 -6.70e-02 9.64e-11 2.95e-07
NC_000008.10 LRRC24 1.17e-01 1.13e-10 3.42e-07
NC_000006.11 TAPBP 1.24e-01 1.16e-10 3.50e-07
NC_000020.10 GMEB2 1.31e-01 1.21e-10 3.61e-07
NC_000015.9 UNC45A 1.35e-01 1.23e-10 3.64e-07
NC_000006.11 B3GALT4 7.83e-02 1.26e-10 3.72e-07
NC_000008.10 FAM83H 1.46e-01 1.41e-10 4.13e-07
NC_000019.9 C19orf56 1.05e-01 1.52e-10 4.44e-07
NC_000021.8 SON 1.88e-02 1.56e-10 4.50e-07
NC_000011.9 CHST1 1.15e-01 1.57e-10 4.50e-07
NC_000006.11 STK19 6.57e-02 1.58e-10 4.50e-07
NC_000017.10 RASL10B 6.52e-02 1.58e-10 4.50e-07
NC_000008.10 FAM83H 1.78e-01 1.76e-10 4.90e-07
NC_000003.11 CELSR3 8.37e-02 1.78e-10 4.92e-07
NC_000017.10 RAI1 -1.42e-01 1.79e-10 4.92e-07
NC_000021.8 DIP2A -1.75e-02 1.80e-10 4.92e-07
NC_000019.9 CYTH2 1.12e-01 1.82e-10 4.95e-07
NC_000003.11 VWA5B2 9.64e-02 1.91e-10 5.18e-07
NC_000005.9 TRIM41 1.06e-01 1.97e-10 5.30e-07
NC_000006.11 ZBTB22 8.60e-02 2.07e-10 5.52e-07
NC_000003.11 PRRT3 1.28e-01 2.11e-10 5.58e-07
NC_000008.10 FAM83H 1.80e-01 2.20e-10 5.72e-07
NC_000003.11 GHRL -1.00e-01 2.34e-10 6.06e-07
NC_000020.10 MATN4 1.13e-01 2.37e-10 6.08e-07
NC_000019.9 PTPRS -1.18e-01 2.38e-10 6.08e-07
NC_000022.10 MEI1 9.96e-02 2.44e-10 6.21e-07
NC_000017.10 PAFAH1B1 -9.75e-02 2.55e-10 6.38e-07
NC_000017.10 SPAG5 1.47e-01 2.94e-10 7.19e-07
NC_000015.9 UNC45A 1.82e-01 3.23e-10 7.88e-07
NC_000022.10 EIF3D 9.67e-02 3.36e-10 8.15e-07
NC_000019.9 CYTH2 2.42e-01 3.41e-10 8.22e-07
NC_000017.10 TEX14 1.37e-01 3.48e-10 8.36e-07
NC_000022.10 TYMP 6.23e-02 3.53e-10 8.42e-07
NC_000017.10 MRC2 7.54e-02 3.56e-10 8.46e-07
NC_000006.11 HIST1H2BK 9.16e-02 3.74e-10 8.84e-07
NC_000012.11 VPS37B 1.80e-01 3.79e-10 8.90e-07
NC_000002.11 GORASP2 7.02e-02 3.82e-10 8.91e-07
NC_000005.9 TRIM7 9.11e-02 3.83e-10 8.91e-07
NC_000015.9 UNC45A 1.44e-01 3.87e-10 8.96e-07
NC_000015.9 ATP10A 4.99e-02 3.91e-10 8.99e-07
NC_000006.11 C6orf154 9.31e-02 3.94e-10 8.99e-07
NC_000019.9 TMC4 1.02e-01 3.94e-10 8.99e-07
NC_000021.8 MRAP -5.13e-02 3.98e-10 9.04e-07
NC_000001.10 B4GALT3 4.72e-02 4.46e-10 1.00e-06
NC_000017.10 TNK1 5.52e-02 4.54e-10 1.02e-06
NC_000019.9 NAT14 1.15e-01 4.66e-10 1.03e-06
NC_000014.8 C14orf43 8.85e-02 4.83e-10 1.06e-06
NC_000022.10 MEI1 7.06e-02 5.10e-10 1.12e-06
NC_000008.10 LOC100130274 1.76e-01 5.18e-10 1.13e-06
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